Semanas 41 a 46a
Variantes detectadas nas cinco regiões brasileiras, de 10/10 a 20/11/21, com 2.911 genomas sequenciados por laboratórios independentes:
As análises são do pesquisador científico Anderson Brito, do Instituto Todos pela Saúde (ITpS).
Com dados de sequenciamento das últimas semanas, até o momento não há registro da variante Ômicron no Brasil. Os impactos desta variante quanto a vacinas, transmissibilidade e severidade de doenças ainda não estão claros, mas estudos seguem em andamento. Para saber mais, clique aqui.
Nos painéis abaixo, vemos as proporções de cada sublinhagem das variantes em circulação no Brasil (que não inclui a Ômicron). Tais proporções devem ser avaliadas com cautela, pois não sabemos ao certo quais estratégias de amostragem foram usadas. Logo, podem existir vieses.
Proporções (%) das variantes detectadas no Brasil em cada semana (datas = último dia das semanas). No mapa, o tamanho dos círculos (pizzas) denotam a quantidade de genomas amostrados nos estados e as cores indicam as variantes.
No relatório desta semana, as sublinhagens (de Delta, Gamma e outras) foram identificadas utilizando as últimas atualizações do sistema de classificação proposto pelo @PangoNetwork (pangoLEARN 2021-11-18, e designações da versão 1.2.102).
Nos mapas abaixo, vemos os municípios de origem de genomas de variantes sequenciadas nas últimas semanas. Apenas genomas submetidos com o nome da cidade de origem são mostrados no mapa. Para saber sobre a cobertura estadual, veja o primeiro mapa (acima).
Dados de vigilância genômica da região Norte. 112 genomas sequenciados por dois laboratórios:
Com dados de: Fiocruz (RJ/AM) Dados de vigilância genômica da região Nordeste. 209 genomas sequenciados por três laboratórios:
Com dados de: Fiocruz (RJ/PE) e LACEN/BA
Não há dados disponíveis de vigilância genômica da região Centro-Oeste entre os dias 10/10 e 20/11/2021. Tais dados poderão eventualmente ser gerados nos próximos dias ou semanas e estarão representados nos próximos relatórios.
Dados de vigilância genômica da região Sudeste. 2.449 genomas sequenciados por quatro laboratórios:
Com dados de: Butantan, LNCC, Fiocruz (RJ) e Hospital Israelita Albert Einstein
Dados de vigilância genômica da região Sul. 141 genomas sequenciados por três laboratórios:
Com dados de: Fiocruz (RJ/AM) e FEEVALE
Para navegar, filtrar e interagir com algumas das informações apresentadas acima, clique aqui. O ITpS agradece aos pesquisadores e laboratórios que coletaram, geraram e submeteram os dados e metadados, aqui apresentados, para o banco de dados Gisaid.
We gratefully acknowledge all data contributors, i.e. the Authors and Originating labs, responsible for obtaining the specimens, and their Submitting labs for generating the genetic sequence and metadata and sharing via the GISAID Initiative (*), on which this research is based.
* Elbe, S., and Buckland -Merrett, G. (2017) Data, disease and diplomacy: GISAID’s innovative contribution to global health. Global Challenges, 1:33-46. DOI: 10.1002/gch2.1018
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/gch2.1018
